據深圳海關發布的消息，香港CEPA優惠政策實施3年以來，港產貨物在深圳市場的競爭力不斷加強，市場需求持續旺盛，使得CEPA受惠產品銷售呈現逐年遞增的健康發展勢頭。據海關總署深圳原產地辦公室統計，2006年深圳口岸共進口香港CEPA項下受惠貨物共1.23億美元，共獲稅款優惠1.08億元人民幣，較2005年分別增長增長了 33.79％和39.66％，比2004年則分別增長了2.1倍和4.69倍。

據深圳海關表示，海關的各項通關改革使深港兩地貨物通關效率得到有效提高，加上深圳具備多元化和低廉的運輸渠道，內地部分口岸的零關稅貨物選擇深圳口岸進行轉關進口，再由陸運和鐵路等渠道運往其他地區。去年，南京、武漢、成都、拱北、廣州和汕頭等10個口岸的部分CEPA貨物經深圳口岸進行轉關進口，受惠貨值為883.32萬美元，稅款優惠 717.23萬元人民幣。