歐盟商標注冊的缺點：

1、共同體商標注冊對商標的著著性要求很高。各成員國只要有一個成員國中有人提出異議，且異議成立，即可導致該注冊被駁回。盡管被駁回商標可以轉而進行逐一國家申請，且保留原申請日，但申請人須向每一申請國支付費用。如果商標的著著性不是很高，則不適合申請歐盟商標注冊。

2、在內部市場協調局申請的時間較難確定。如果一切順利，可能在一年內獲得注冊。但是，只在有異議，該商標就不能及時得到注冊。解決異議需花費較長時間，通常是2年左右。