根據財政部和發展改革委的批復，玉樹災后恢復重建資金總規模為316.5億元，截至2010年10月15日，青海省本級共收到資金183.1億元。青海省本級已撥付資金75.2億元。災后恢復重建已完成工程投資36.2億元。
審計結果顯示，玉樹地震災后恢復重建有序開展；災區群眾得到妥善安置，生活條件逐步改善；災后恢復重建資金和項目管理水平逐步提高。重建資金管理使用和項目建設總體情況較好，審計未發現嚴重違法違規問題。
審計結果指出，由于災后恢復重建涉及面廣、任務重、時間緊、要求高、情況復雜，審計也發現資金管理使用和工程質量管理方面存在不規范、不完善的問題。
審計發現，截至2010年10月15日，青海省收到的24.92億元捐贈資金尚未明確到具體項目。審計指出上述問題后，青海省人民政府已將這筆資金明確到具體項目，正在征求捐贈者的意見。
同時，審計還發現玉樹州財政局欠撥玉樹應急防洪及供水工程建設資金4286萬元；玉樹縣財政局違規從貸款擔保資本金6280萬元中提取62.8萬元作為貸款擔保工作經費；囊謙縣財政局在未按規定對災后恢復重建項目投資完成情況作嚴格審核的情況下，將7166萬元撥付縣建設環保局。審計指出上述問題后，相關部門已進行了整改。
此外，由于項目管理機構專業人員缺乏，加之高原嚴重缺氧等原因，截至2010年10月15日，審計抽查的99項重建項目中，有95項可研報告和初步設計及概算未及時得到批復、施工圖未及時審定，影響項目的正常施工。目前，審計抽查發現的95項重建項目可研報告和初步設計及概算未經審查的問題已經全部整改到位。
審計署18日發布2011年第8號公告，公布了玉樹地震災后恢復重建2010年跟蹤審計結果。審計結果表明，重建資金管理使用和項目建設總體情況較好，審計未發現嚴重違法違規問題。
2010年6月至10月，審計署對玉樹地震災后恢復重建資金管理使用情況進行了審計，并從2010年已開工的298項重建項目中，重點抽取學校、醫院、農房等99項進行審計，涉及概算總投資76億多元。
